从表型到机理的蛋白研究整体科研解决方案
ProteomeSolution™

 

DNA是剧本,蛋白质才是“演员”。

蛋白质是有机体表型复杂性的最终决定分子,蛋白质组学已成为后基因时代研究热点和必然趋势。

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      多数情况下,有机体表观的表型并非单基因遗传所致,而是一系列蛋白的变化以及多种蛋白之间的相互作用共同决定。对不同基因型或不同状态下组织蛋白表达谱变化的研究,可为表型发生机制的研究筛选蛋白标志物,提供候选蛋白。进一步的,对特定通路中蛋白相互作用的研究,有助于建立相应的信号转导通路体系,从而探讨表观表型发生的机制。因此,蛋白调控网络的研究通常有两个方向的思路:

      - 非靶向蛋白组学研究,即利用差异样本,通过质谱等手段鉴定样本中的差异蛋白组,从差异蛋白组中鉴定可能的调控网络并进行功能研究,其优势在于高通量鉴定未知蛋白。

      - 靶向蛋白研究,即已知若干可能参与调控的基因/蛋白,在生物样本中鉴定目的蛋白的表达量、时空表达模式和相互作用,以及蛋白功能的验证,从而详细解析调控机理。

 

      二者结合一般是高效率研究蛋白调控网络研究的方式,我们的ProteomeSolution™服务正是基于这个思路。

 

适用于研究不同样本间的蛋白组水平的表达差异

      - 抗逆:正常样本和不同梯度胁迫处理(如高温、高盐)后的样本

      - 表型差异:遗传背景未知,表现出不同表型(如叶片颜色)的同一物种样本

      - 基因型差异:野生型与基因改造(如基因敲除、过表达)样本

 

      在全蛋白质组层面上开展蛋白质表达水平的质谱定量分析,结合个性化的高级生物信息学分析,构建该生物学问题的蛋白水平的调控草图,找到影响差异形成的关键因子。同时利用WB、IF等多种蛋白检测手段,对精选的关键蛋白进行深入的蛋白定量、定位分析的全套服务。


您提供
感兴趣的生物学问题
例如:通过比较不同品种的果实研究
成熟过程中果肉软化的分子机制
具有表型特征的差异样本
提供至少两组样本,每组至少三个生物学重复。也可以比较更多组之间的差异
艾比玛特帮您实现
比较蛋白组学实验、生物信息学分析和数据挖掘
iTRAQ原始数据和差一单吧分析,包括GO,KEGG,Pfam和CORUM。异蛋白表达热图,差异蛋白功能分类,基于文献或差异蛋白的通路挖掘和重绘。可直接用于文章发表的数据图表
单克隆抗体和差异蛋白WB内源验证
针对6个蛋白开发单克隆抗体,提供全部抗原和抗体小样。并提供差异蛋白WB内源验证的结果
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供至少两组样本,每组至少三个生物学重复。也可以比较更多组之间的差异
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单克隆抗体和差异蛋白WB内源验证
针对6个蛋白开发单克隆抗体,提供全部抗原和抗体小样。并提供差异蛋白WB内源验证的结果
靠组学数据的堆砌已经无法发表高质量文章,艾比玛特帮我挖掘了数据的价值,找到了后续研究的突破口。
案例分析

Appl Microbiol Biotechnol, 2015

Proteomic analysis of conidia germination in Fusariumoxysporum  f. sp. cubense tropical race 4 reveals new targets in ergosterol biosynthesis pathway for controlling Fusarium wilt of banana

Gui-Ming Deng1,2,3 & Qiao-Song Yang1,2 & Wei-Di He1,2,4 & Chun-Yu Li1,2 & Jing Yang1,2,3 &Cun-Wu Zuo1,2,3 & Jie Gao1,2,3 & Ou Sheng1,2 & Shao-Yun Lu3 & Sheng Zhang5 &Gan-Jun Yi1,2,3

微生物学研究人员通过iTRAQ对比尖孢镰刀菌孢子萌发不同时期菌株的蛋白表达差异,找到了1009个差异表达蛋白,发现麦角固醇合成途径在孢子萌发过程中起到关键作用。这个结果通过Western blot的验证,成为有说服力的证据。


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The Plant Cell, 2014

GLUTELIN PRECURSOR ACCUMULATION3 Encodes a Regulator of Post-Golgi Vesicular Traffic Essential for Vacuolar Protein Sorting in Rice Endosperm

Yulong Ren,a,b,1 Yihua Wang,a,1 Feng Liu,a,1 Kunneng Zhou,a Yu Ding,c Feng Zhou,a Ying Wang,b Kai Liu,a Lu Gan,b
Weiwei Ma,b Xiaohua Han,a Xin Zhang,b Xiuping Guo,b Fuqing Wu,b Zhijun Cheng,b Jiulin Wang,b Cailin Lei,b
Qibing Lin,b Ling Jiang,a Chuanyin Wu,b Yiqun Bao,d Haiyang Wang,b and Jianmin Wana,b,2


植物科学研究人员通过得到的高品质抗体继续针对更多样本进行Western blot蛋白表达研究,结合相应的生理学实验,绘制了PGA3蛋白在水稻胚乳中液泡蛋白定向转运过程中的调控作用模型。


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引用文章摘选
我们的团队
国家“千人计划”特聘专家领衔,几十个海归博士构成的科学家团队

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